Generalmente, he visto que para la creación de prototipos de interfaces hombre máquina, se usan herramientas de diseño de imagenes y/o presentaciones, pero en este caso, Fedora 18, en sus repositorios incluye a Pencil, el cual es un software para el diseño de interfaces, el cual es multiplataforma y muy agradable, pero mas que palabras, los invito a conocerlo a través del siguiente video:
http://ia700302.us.archive.org/29/items/IntroduccionAPencil/pencil.ogv
Espero les agrade.